2000年,学院作为东北大学首批基层学术组织改革试点单位之一,在国内率先进行了基层学术组织改革,组建了以学科建设为龙头、学术带头人为核心,集学科建设、教学科研、人才培养、行政管理、党的建设“五位一体”的新型教学科研基层组织——研究所。基层组织模式实现了“学科建设与专业建设的结合”、“科研与教学的结合”、“学术带头人与管理者的结合”,较好地适应了建设高水平研究型大学的发展需要。此后,学院不断总结基层组织改革中的经验教训,相继进行了五轮基层学术组织调整,使基层组织不断焕发出新的生机和活力,促进了学科建设、教学改革、科学研究和人才培养等各项工作的快速协调发展,推动了研究性大学建设的进程。
教学科研基层组织改革奠定了建设研究型大学的组织基础和思想基础;为学院后来推动的其它各项改革创造了契机和条件。
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